全氟醚O型圈和氟橡胶O型圈都属于耐高温、耐腐蚀的密封材料，但在分子结构、性能表现、应用范围和成本方面差异明显。

从分子结构来看，氟橡胶由氟碳链与橡胶基体组成，含氟量一般在65%到70%之间。全氟醚则完全由氟和氧构成，分子结构更稳定，几乎不存在弱点键，因此化学惰性更强。

在性能表现方面，氟橡胶O型圈的耐温范围大约为零下二十度至二百度，全氟醚则可覆盖零下二十度至三百度以上。在化学耐受性上，氟橡胶能抵抗大多数油类、溶剂和酸碱，但在强氧化剂或强酸强碱中性能下降。全氟醚几乎能耐受所有化学介质，包括强氧化剂和高纯气体。

在应用范围方面，氟橡胶O型圈常用于汽车、石化和航空设备，适合中高端工况。全氟醚O型圈则应用于半导体、超净工艺、制药和航空航天等极端环境，对密封可靠性要求极高的设备尤为适用。

在成本方面，氟橡胶价格适中，适合大批量应用；全氟醚生产工艺复杂，材料成本高昂，价格远高于氟橡胶，一般仅用于关键部件。

全氟醚O型圈与氟橡胶O型圈在结构、性能、应用和成本上都有明显区别。选择时需要根据实际工况来决定。